Is-serje tirrakkonta l-avventuri ta’ erba’ fkieren u l-kaptan u missier adottiv tagħhom, il-far Splinter, li jgħixu fid-drenaġġ ta’ New York. L-espożizzjoni għal mutaġenu biddel il-ħamsa minnhom fi ħlejjaq bħall-bniedem. Mħarrġa minn Splinter fl-arti tan-Ninjutsu, l-erba’ fkieren jiġġieldu kontra diversi theddidiet għall-belt, kemm jekk ikunu ninjas oħra, mutanti, aljeni, kriminali jew xi kultant saħansitra kreaturi sopranaturali, kollha jippruvaw jaħbu l-eżistenza tagħhom mill-pubbliku.