Een anemoonvis moet zorgen voor zijn enige zoon, Nemo, gehandicapt door een geatrofieerde vin.
Op zijn eerste schooldag besluit Nemo naar de oppervlakte te zwemmen om een mysterieuze boot aan te raken.
Op dat moment werd hij ontvoerd door een duiker.
De vader gaat hem zoeken.
Hij ontmoet Dory, een doktersvis met acute geheugenproblemen die beweert de boot te hebben zien passeren.