Op een dag krijgt hij een puzzel gevonden tijdens archeologische opgravingen. Niemand was er eerder in geslaagd om dit oude object te reconstrueren, maar de jonge Yugi slaagde er uiteindelijk in het in elkaar te zetten. Op dit moment wordt de geest van een oude farao van Egypte vrijgelaten, tot dan toe opgesloten in de puzzel, die Yugi's lichaam zal gaan bewonen. Hij is zeker van zichzelf en deinst nergens voor terug. De farao is een specialist in alle soorten spellen. Vanaf het achtste deel richt de manga zich vooral op monsterduels.