سيريز چار ڪڇين ۽ انهن جي ماسٽر ۽ گود وٺندڙ پيءُ، چوٿون اسپلنٽر، نيو يارڪ جي گٽرن ۾ رهندڙن جي ڪردارن کي بيان ڪري ٿو. هڪ ميوٽيجين جي نمائش انهن سڀني پنجن کي انسان وانگر مخلوق ۾ تبديل ڪيو. Ninjutsu جي فن ۾ Splinter پاران تربيت ڏني وئي، چار ڪڙيون شهر کي مختلف خطرن جي خلاف وڙهندا آهن، اهي ٻيا ننجا، ميوٽنٽ، اجنبي، مجرم يا ڪڏهن ڪڏهن مافوق الفطرت مخلوق آهن، سڀ پنهنجي وجود کي عوام کان لڪائڻ جي ڪوشش ڪري رهيا آهن.