Seriali tregon aventurat e katër breshkave dhe të zotit dhe babait birësues të tyre, miut Splinter, që jeton në kanalizimet e Nju Jorkut. Ekspozimi ndaj një mutagjeni i ktheu të pesë ata në krijesa të ngjashme me njeriun. Të trajnuar nga Splinter në artin e Ninjutsu, katër breshkat luftojnë kundër kërcënimeve të ndryshme për qytetin, qofshin ninxha të tjerë, mutantë, të huaj, kriminelë apo ndonjëherë edhe krijesa të mbinatyrshme, të gjitha duke u përpjekur të fshehin ekzistencën e tyre nga publiku.